文件名称:ViennaRNA-1.6.1
- 所属分类:
- 其它资源
- 资源属性:
- [Windows] [Visual C] [源码]
- 上传时间:
- 2008-10-13
- 文件大小:
- 1.2mb
- 下载次数:
- 0次
- 提 供 者:
- 朱*
- 相关连接:
- 无
- 下载说明:
- 别用迅雷下载,失败请重下,重下不扣分!
介绍说明--下载内容均来自于网络,请自行研究使用
ViennaRNA-1.6.1,用于预测RNA二级结构的软件,运行在UNIX或Linux平台下-ViennaRNA - 1.6.1 for RNA secondary structure prediction software. run on UNIX or Linux platforms
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
压缩包 : 41695033viennarna-1.6.1.rar 列表 ViennaRNA-1.6.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\vienna13.par ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\INSTALL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\THANKS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\NEWS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\default.par ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\configure ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\config.sub ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\missing ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\COPYING ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\aclocal.m4 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\depcomp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\INSTALL.configure ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\config.h.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\ChangeLog ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\configure.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\install-sh ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\config.guess ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA.spec.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\compile ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\acinclude.m4 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\AUTHORS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\RNA_wrap.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\RNAfold.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\test.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\RNA.pm ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\Makefile.PL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\RNA.i ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Perl\RNAfold.cgi ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\part_func_co.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\ProfileAln.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\params.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\utils.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\fold_vars.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\subopt.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\energy_const.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\treedist.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\aln_util.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\stringdist.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\cofold.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\RNAstruct.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\dist_vars.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\pair_mat.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\part_func.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\profiledist.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\alifold.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\inverse.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\energy_par.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\fold.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\PS_dot.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\duplex.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\H\edit_cost.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\b2mt.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\Fold ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\relplot.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\coloraln.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\rotate_ss.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\b2ct.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\popt.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\ct2b.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\dpzoom.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\colorrna.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\cmount.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Utils\mountain.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\nucleic.std ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\macinit.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\multi.std ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\translate.patch ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\ureadasn.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Readme ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\readseq ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\ureadseq.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Makefile ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Make.ncbi ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\readseqSIOW.make ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Make.com ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\ureadseq.c.orig ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\readseq.c.orig ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Formats ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\macinit.r ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Stdfiles ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\readseq.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\upper.std ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\ureadseq.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\alphabet.std ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\Readseq.help ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\add.gdemenu ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Readseq\ureadseq.h.orig ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAplfold.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAinverse.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAheat.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAheat.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAduplex.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAlib.info ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAfold.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAplot.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAduplex.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAdistance.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAplfold.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAsubopt.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNALfold.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAeval.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAsubopt.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNApdist.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAalifold.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNApdist.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\texinfo.tex ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAeval.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAalifold.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAplot.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAlib.texinfo ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAcofold.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAinverse.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNALfold.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAcofold.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAdistance.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\man\RNAfold.1.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAduplex.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNApdist.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAeval.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAinverse.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNALfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAplfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAsubopt.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAalifold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAdistance.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAcofold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNApaln.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAplot.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAheat.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Progs\RNAfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\treeplot.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\cluster.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\PS3D.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\utils.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\cluster.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\distance_matrix.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\StrEdit_CostMatrix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\AS_main.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\treeplot.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\split.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\PS3D.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\distance_matrix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\statgeom.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\statgeom.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\AnalyseDists.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\AD_main.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\AnalyseSeqs.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Cluster\split.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\INSTALL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\NEWS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\configure ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\missing ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\COPYING ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\aclocal.m4 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\depcomp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\config.h.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\ChangeLog ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\configure.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\install-sh ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\config.guess ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\TODO ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\AUTHORS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\mkinstalldirs ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CHANGES ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\INSTALL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\simple_win32.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\configure ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\config.sub ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\Makefile ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\gd.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2.dsw ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_anim.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2res.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\COPYING ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\descrip.mms ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2dll.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\configure.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\install-sh ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\config.guess ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2demo.dsp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\TODO ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\Doxyfile ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\g2_main.dox ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\doc\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_graphic_pd.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_device.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_ui_device.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_control_pd.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_config.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_physical_device.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_fif.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_ui_control.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_util.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_util.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_graphic_pd.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_splines.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_ui_graphic.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_control_pd.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_virtual_device.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_physical_device.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_device.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_ui_virtual_device.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2_virtual_device.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\g2.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\g2_FIG.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\g2_FIG.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\g2_FIG_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\g2_FIG_P.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\FIG\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\g2_PS_P.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\g2_PS.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\g2_PS_definitions.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\g2_PS_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\g2_PS.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\PS\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32.rc ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_Win32.ico ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2res.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32_thread.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\g2_win32_P.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\resource.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\Win32\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\g2_gd.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\g2_gd_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\g2_gd_P.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\g2_gd.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\GD\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\g2.xpm ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\g2_X11.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\g2_X11_P.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\g2_X11.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\g2_X11_funix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\src\X11\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\include\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\README.perl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\g2_wrap.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\g2.pm ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\Makefile.PL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\perl\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\g2_splines_demo.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\penguin.inc ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\simple_PS.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\penguin.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\demo_f.f ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\xlink.opt ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\simple_X11.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\simple_gd.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\simple_FIG.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\pointer.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\Makefile ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\handles.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\g2_arc.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\descrip.mms ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\simple_win32.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\g2_test.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\demo_cpp.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\g2_test.f ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\g2_anim.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\demo\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\requests ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\traces.0 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\output.0 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\autom4te.cache\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\Makefile.PL.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\typemap ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\test.pl ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\Changes ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\G2.xs ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\G2.pm ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\MANIFEST ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\Makefile.PL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\Template ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\CVS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\CVS\Entries ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\CVS\Repository ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\g2-0.70\g2_perl\CVS\CVS\Root ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforester_options.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforest.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnafuncs.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\utils.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\fold_vars.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_profile_alignment.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\Arguments.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnafuncs.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\misc.t.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\wmatch.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\readgraph.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_profile_alignment.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\Arguments.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_alphabet.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\pointer.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforest.t.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\treeedit.t.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\types.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\graphtypes.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\algebra.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforestsz.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\progressive_align.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforest.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\matrix.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_alignment.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\pairs.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforestbase.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\progressive_align.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\wmatch.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\debug.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_algebra.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforestsz.t.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\unpairs.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforestali.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\part_func.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforest.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\glib.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforestsz.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_alignment.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\treeedit.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforestsz.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\main.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rnaforester_options.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\fold.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_algebra.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\misc.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\ppforestbase.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\alignment.t.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\match.defs ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\rna_alphabet.cpp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\term.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\src\alignment.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\man ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\man\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\man\RNAforester.1 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\RNAforester\man\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\globals.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\baum.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\INSTALL ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\baum.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\nachbar.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\NEWS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\configure ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\getopt.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\COPYING ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\getopt.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\aclocal.m4 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\getopt1.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\main.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\config.h.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\ChangeLog ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\globals.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\configure.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\cache_util.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\nachbar.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\cache.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\acinclude.m4 ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\AUTHORS ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\hpin.nolp.log ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\hpin.e.log ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\traj.ae ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\hpin.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\traj.nolp ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\README ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\traj.e ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\hpin.log ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\traj ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\Kinfold\Example\hpin.ae.log ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\part_func_co.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\alipfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\RNAstruct.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\list.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\ProfileDist.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\naview.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\duplex.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\Makefile.am ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\utils.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\cofold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\treedist.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\LPfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\Makefile.in ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\alicircfold.inc ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\intloops.h ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\list.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\read_epars.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\subopt.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\Lfold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\energy_par.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\part_func.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\fold_vars.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\circfold.inc ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\dist_vars.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\inverse.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\ProfileAln.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\stringdist.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\alifold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\fold.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\aln_util.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\PS_dot.c ViennaRNA-1.6.1\ViennaRNA-1.6.1\lib\params.c