文件名称:viterbiaEM
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1.用隐马尔科夫模型（HMM）模拟肿瘤细胞整个染色体的拷贝数（CN）变异。并用viteri算法得到最可能的（CN）状态转移序列；
2.使用baum welch算法根据所给序列数据和初始状态转移矩阵，重新估算状态转移矩阵。-HMM, Hidden Markov, baulm welch, viterbi, SNP-array
2.使用baum welch算法根据所给序列数据和初始状态转移矩阵，重新估算状态转移矩阵。-HMM, Hidden Markov, baulm welch, viterbi, SNP-array
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下载文件列表
viterbi&EM
..........\code
..........\....\baum_welch.cpp
..........\....\baum_welch.h
..........\....\CN.txt
..........\....\CRL2324_tQN.txt
..........\....\dataft.cpp
..........\....\drawimg.m
..........\....\EM_states.txt
..........\....\hmm.cpp
..........\....\hmm.h
..........\....\parameters.txt
..........\HMM实验报告.docx
..........\images
..........\......\allinone.jpg
..........\......\baum_welch.png
..........\......\chromo1.jpg
..........\......\chromo10.jpg
..........\......\chromo11.jpg
..........\......\chromo12.jpg
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..........\......\chromo8.jpg
..........\......\chromo9.jpg
..........\......\CN.png
..........\......\EM_states.png
..........\......\viterbi.png