文件名称:search_genome
- 所属分类:
- 生物技术
- 资源属性:
- [C/C++] [源码]
- 上传时间:
- 2008-10-13
- 文件大小:
- 146.05kb
- 下载次数:
- 0次
- 提 供 者:
- Fayer *******
- 相关连接:
- 无
- 下载说明:
- 别用迅雷下载,失败请重下,重下不扣分!
介绍说明--下载内容均来自于网络,请自行研究使用
一个自制的生物信息学程序。
这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。
程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
这个程序目的是在基因组文件bsubt168_whole.nuc(部分)中查找设置文件ss.ini所记录的短核苷酸序列CTTAAG(这种短核苷酸一般称寡核苷酸)及其互补序列在该基因组的每10000个碱基中出现的次数。
程序先将碰到的寡核苷酸及其互补序列的位置保存在临时文件ss.tmp中,然后利用这个文件统计每10000个碱基中它们的出现次数并记录在ss.csv中(可用excel打开)。如果某10000个碱基中的出现次数为0,则不被记录。
(系统自动生成,下载前可以参看下载内容)
下载文件列表
压缩包 : 71477226search_genome.rar 列表 ss.ini bsubt168_whole.nuc ss.c