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  1. calculate_R_matrix

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  2. use the HeatS+ProbS hybrid algorithm introduced by Zhou et al. [74] on the two bipartite networks to determine the edge weight in both miRNA projections. By which, the resource transfer process, as one of the weighting m
  3. 所属分类:生物技术

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:1kb
    • 提供者:jiezhou
  1. known_lincRNA

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  2. 主要用于已知lncRNA的分析,从gff文件中查找已知的lncRNA,并从中找到它的序列和外显子个数,长度分布信息(known lncRNA prediction)
  3. 所属分类:Linux/Unix编程

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:3kb
    • 提供者:zfc947433815
  1. lncRNA_antisen_target

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  2. 用来做lncRNA的靶基因预测,利用自由能结合最小值预测,并对预测结果做简化处理(lncRNA target prediction)
  3. 所属分类:Linux/Unix编程

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:3kb
    • 提供者:zfc947433815
  1. cis_tar

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  2. 查找lncRNA附近的基因,lncRNA上下游10kb到100kb内的基因(search lncRNA nearby gene)
  3. 所属分类:Linux/Unix编程

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:2kb
    • 提供者:zfc947433815
  1. lncRNA_prediction

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  2. 未知的新的lncRNA的预测,并将未知的lncRNA的特征图形化展示(novel lncRNA prediction)
  3. 所属分类:Linux/Unix编程

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:5kb
    • 提供者:zfc947433815
  1. PhyloCSF

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  2. lncRNA的保守性分析,主要用来进行lncRNA的保守性评估(lncRNA coservation analysis)
  3. 所属分类:Linux/Unix编程

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:1kb
    • 提供者:zfc947433815
  1. dsec-all-ncRNA-r1.3.fasta

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  2. blast比对,ncRNA,lncRNA,可以比对lnc(blast alignment,ncRNA,lncRNA,may can align lnc)
  3. 所属分类:其他小程序

    • 发布日期:2024-11-08
    • 文件大小:2kb
    • 提供者:xiao15832

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