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gromacs-3.3.3.tar
- 最著名最快的分子模拟软件，使用汇编语言完成了程序热点部分-The most famous of the fastest molecular simulation software, the use of assembly language completed the hot part of the procedure
trajectory_converter.tar
- a scr ipt can trans the trajectory file under amber/gromacs form. Notice all atom should be in stardard protein PDB form.
gromacs-4.6.1.tar
- 很普遍的分子动力学模拟软件，目前最新的版的，很好用。-Very common molecular dynamics simulation software, the latest version, is useful.
amber力场
- amber力场源码，gromacs可用，版本4.0
xdrfile-1.1.4
- gromacs分析轨迹工具xdrfile，最新版本1.1.4，可以在任意平台下使用，不需要有gromacs安装环境
rmsd
- 分子模拟软件gromacs里面的gmx_tool的rms.c代码， 用于计算rmsd-gmx_rms.c in the simulation software, grimacs. It can be used to calculate RMSD.
gromacs-5.0.2.tar
- Gromacs是一种多功能包进行分子动力学模拟，即系统的数百数以百万计的粒子运动的牛顿方程。(GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.)
gromacs-5.1.3.tar
- 分子模拟计算，蛋白，多肽，核酸，适合初学者，有经验论坛，多多讨论(Molecular simulation, protein, polypeptide, nucleic acid)